Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Genomic insights into the population history of circumpolar Arctic dogs
Stockholms universitet, Humanistiska fakulteten, Institutionen för arkeologi och antikens kultur. University of Copenhagen.ORCID-id: 0000-0003-1610-3402
2020 (Engelska)Doktorsavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
Abstract [en]

The Siberian and North American Arctic have both borne witness to numerous migrations of humans and with them their dogs. This PhD thesis is based on whole genome data from 22 Siberian dogs and 72 North American Arctic dogs, in addition to 186 mitochondrial genomes Siberian and North American Arctic dogs. Mitochondrial genome data allowed for the identification of migration events that introduced distinct dog populations to North America, associated with different cultural complexes arriving to the region. A novel mitochondrial clade was also identified in dogs from eastern Siberia and Alaska. Genetic analysis was performed to confirm the macroscopic identification of fur used to make clothing in the Arctic in conjunction with stable isotope analyses to explore dietary differences of dog populations across the circumpolar region. The whole genome data generated for this PhD also detected and explored evidence for several gene flow events from West Eurasian dogs into the dogs of Siberia starting 10,900 BP. There was an additional gene flow event that introduced Near East related ancestry to the dogs of the Siberian Steppe before the Late Bronze Age. Dogs carrying this West Eurasian ancestry spread throughout Siberia, reaching northwestern Siberia by the Iron Age, by 2,000 BP. Further gene flow was detected later in Siberia from West Eurasia a thousand years later. North American Arctic dogs universally carry the Near East related ancestry that is seen in Siberian dogs starting in the Bronze Age, showing it had reached the Bering Strait before the ancestors of the Inuit departed Siberia for Alaska. Once in North America Inuit dogs experienced several other gene flow events from pre-contact subarctic dogs, modern European dogs, and wolves. The population structure seen in North American Arctic dogs reflects geography and the subsequent isolation as well as population turnover events associated with catastrophic epidemics in the dog populations. Finally, a simple method was developed to evaluate and remove human contamination from ancient DNA datasets originating from faunal taxa. All together this thesis has compiled genomic information from 94 Arctic dogs to shed light upon the genetic history of these dogs from the early Holocene through to the present day. This dataset has been able to provide insight not only into past dynamics of Arctic dogs but also a much needed resource for understanding and preserving the indigenous dog populations still present in the Arctic that face continued challenges of globalisation and climate change.

Abstract [sv]

Där har varit många migrationer av människor, och med dem deras hundar, i de sibiriska och nordamerikanska delarna av Arktis. Denna doktorsavhandling är baserad på hela genomdata från 22 sibiriska hundar och 72 nordamerikanska arktiska hundar, samt 186 mitokondriella genom från arktiska hundar från Sibirien och Nordamerika. De mitokondriella genomen möjliggjorde identifiering av migrationer av hundar som introducerade distinkta populationer till Nordamerika, associerade med olika kulturella komplex som anlände till regionen. En ny mitokondriell klad identifierades också hos hundar från östra Sibirien och Alaska. Genetiska analyser utfördes för att bekräfta den makroskopiska identifieringen av päls som användes för att göra kläder i Arktis tillsammans med stabila isotopanalyser för att undersöka dietskillnaderna hos hundpopulationer i den cirkumpolära regionen. Hela genomdata som genererats i denna avhandling upptäckte och undersökte bevis för flera genflöden från västra -eurasiska hundar till sibiriska hundar med början för 10 900 B.P. Det fanns ytterligare ett genflöde före den sena bronsåldern som introducerade börd från Främre Orienten till hundar från den sibiriska stäppen. Hundar som bär denna väst-eurasiska härkomst spred sig över Sibirien och hade nått de nordvästra delarna vid tiden för järnålderns början. Ytterligare genflöde upptäcktes senare i Sibirien från Västeurasien med början för 1 000 år sedan. De arktiska hundarna från Nordamerika har samma börd från Främre Orienten som ses i de sibiriska hundarna i början av bronsåldern, vilket visar att detta genflöde hade nått Berings sund innan förfäderna till inuiterna lämnade Sibirien för Alaska. När de hade nått Nordamerika upplevde de inuitiska hundarna flera andra genflöden från för-kontakt subarktiska hundar, moderna europeiska hundar och vargar. Befolkningsstrukturen i de arktiska hundarna från Nordamerika återspeglar geografi och den efterföljande isoleringen, samt befolkningsomsättningar förknippade med katastrofala epidemier i hundpopulationerna. Slutligen utvecklades en enkel metod för att utvärdera och ta bort mänskliga kontamineringar från gammalt DNA som härrör från fauna. Sammantaget har denna avhandling sammanställt genomisk information från 94 arktiska hundar för att belysa den genetiska historien för dessa hundar från tidigt Holocen till nutid. Dessa data har kunnat ge insikter i den historiska dynamiken hos arktiska hundar, samt också tjäna som en välbehövlig resurs för att förstå och bevara de inhemska hundpopulationer som fortfarande finns i Arktis och som står inför fortsatta utmaningar av globalisering och klimatförändringar.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Copenhagen: University of Copenhagen, Stockholm University , 2020. , s. 49
Nyckelord [en]
Dogs, Arctic, Inuit, Migration, Siberia, Greenland, Sled Dog
Nationell ämneskategori
Arkeologi
Forskningsämne
arkeologi med inriktning mot laborativ arkeologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:su:diva-180748OAI: oai:DiVA.org:su-180748DiVA, id: diva2:1422832
Disputation
2020-04-17, The GLOBE Institute, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Disputationen genomförs via Zoom, Copenhagen, 14:00 (Engelska)
Opponent
Handledare
Tillgänglig från: 2020-04-15 Skapad: 2020-04-09 Senast uppdaterad: 2020-05-26Bibliografiskt granskad
Delarbeten
1. Specialized sledge dogs accompanied Inuit dispersal across the North American Arctic
Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Specialized sledge dogs accompanied Inuit dispersal across the North American Arctic
Visa övriga...
2019 (Engelska)Ingår i: Proceedings of the Royal Society of London. Biological Sciences, ISSN 0962-8452, E-ISSN 1471-2954, Vol. 286, nr 1916, artikel-id 20191929Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Domestic dogs have been central to life in the North American Arctic for millennia. The ancestors of the Inuit were the first to introduce the widespread usage of dog sledge transportation technology to the Americas, but whether the Inuit adopted local Palaeo-Inuit dogs or introduced a new dog population to the region remains unknown. To test these hypotheses, we generated mitochondrial DNA and geometric morphometric data of skull and dental elements from a total of 922 North American Arctic dogs and wolves spanning over 4500 years. Our analyses revealed that dogs from Inuit sites dating from 2000 BP possess morphological and genetic signatures that distinguish them from earlier Palaeo-Inuit dogs, and identified a novel mitochondrial clade in eastern Siberia and Alaska. The genetic legacy of these Inuit dogs survives today in modern Arctic sledge dogs despite phenotypic differences between archaeological and modern Arctic dogs. Together, our data reveal that Inuit dogs derive from a secondary pre-contact migration of dogs distinct from Palaeo-Inuit dogs, and probably aided the Inuit expansion across the North American Arctic beginning around 1000 BP.

Nyckelord
archaeology, geometric morphometrics, ancient DNA, migration, Canis lupus familiaris, circumpolar
Nationell ämneskategori
Biologiska vetenskaper Historia och arkeologi
Identifikatorer
urn:nbn:se:su:diva-177576 (URN)10.1098/rspb.2019.1929 (DOI)000499474600006 ()31771471 (PubMedID)
Tillgänglig från: 2020-01-15 Skapad: 2020-01-15 Senast uppdaterad: 2020-04-15Bibliografiskt granskad
2. Archives of human-dog relationships: Genetic and stable isotope analysis of Arctic fur clothing
Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Archives of human-dog relationships: Genetic and stable isotope analysis of Arctic fur clothing
Visa övriga...
(Engelska)Manuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
Nationell ämneskategori
Historia och arkeologi Biologiska vetenskaper
Identifikatorer
urn:nbn:se:su:diva-180808 (URN)
Tillgänglig från: 2020-04-15 Skapad: 2020-04-15 Senast uppdaterad: 2020-04-15Bibliografiskt granskad
3. Genomic insight into the population history of Siberian dogs
Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Genomic insight into the population history of Siberian dogs
Visa övriga...
(Engelska)Manuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
Nationell ämneskategori
Historia och arkeologi Biologiska vetenskaper
Identifikatorer
urn:nbn:se:su:diva-180805 (URN)
Tillgänglig från: 2020-04-15 Skapad: 2020-04-15 Senast uppdaterad: 2020-04-15Bibliografiskt granskad
4. Pre-contact Inuit dog genomes show a lost wealth of dog diversity in the North American Arctic
Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Pre-contact Inuit dog genomes show a lost wealth of dog diversity in the North American Arctic
Visa övriga...
(Engelska)Manuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
Nationell ämneskategori
Historia och arkeologi Biologiska vetenskaper
Identifikatorer
urn:nbn:se:su:diva-180809 (URN)
Tillgänglig från: 2020-04-15 Skapad: 2020-04-15 Senast uppdaterad: 2020-04-15Bibliografiskt granskad
5. Competitive mapping allows to identify and exclude human DNA contamination in ancient faunal genomic datasets
Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Competitive mapping allows to identify and exclude human DNA contamination in ancient faunal genomic datasets
Visa övriga...
(Engelska)Manuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
Nationell ämneskategori
Historia och arkeologi Biologiska vetenskaper
Identifikatorer
urn:nbn:se:su:diva-180811 (URN)
Tillgänglig från: 2020-04-15 Skapad: 2020-04-15 Senast uppdaterad: 2020-04-15Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Genomic insights into the population history of circumpolar Arctic dogs(8818 kB)78 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 8818 kBChecksumma SHA-512
5d12422a5c82b214f09dae4221adb5383c5bfd97b04c3403721e3267584d691e96f0e2ce55eea67d5200e2136c17f6b0f5266ccd3c4345f46bc2a44d6945afdb
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Feuerborn, Tatiana Richtman
Av organisationen
Institutionen för arkeologi och antikens kultur
Arkeologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 78 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 210 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf