Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Estimating the information content of genetic sequence data
Stockholms universitet, Naturvetenskapliga fakulteten, Matematiska institutionen.ORCID-id: 0000-0003-2767-8818
Antal upphovsmän: 22023 (Engelska)Ingår i: The Journal of the Royal Statistical Society, Series C: Applied Statistics, ISSN 0035-9254, E-ISSN 1467-9876, Vol. 72, nr 5, s. 1310-1338Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

A prominent problem in analysing genetic information has been a lack of mathematical frameworks for doing so. This article offers some new statistical methods to model and analyse information content in proteins, protein families, and their sequences. We discuss how to understand the qualitative aspects of genetic information, how to estimate the quantitative aspects of it, and implement a statistical model where the qualitative genetic function is represented jointly with its probabilistic metric of self-information. The functional information of protein families in the Cath and Pfam databases are estimated using a method inspired by rejection sampling. Scientific work may place these components of information as one of the fundamental aspects of molecular biology.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2023. Vol. 72, nr 5, s. 1310-1338
Nyckelord [en]
functional information, mutual information, rejection sampling, self-information
Nationell ämneskategori
Sannolikhetsteori och statistik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:su:diva-221410DOI: 10.1093/jrsssc/qlad062ISI: 001032671000001Scopus ID: 2-s2.0-85183119634OAI: oai:DiVA.org:su-221410DiVA, id: diva2:1798843
Tillgänglig från: 2023-09-20 Skapad: 2023-09-20 Senast uppdaterad: 2024-03-04Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextScopus

Person

Hössjer, Ola

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Hössjer, Ola
Av organisationen
Matematiska institutionen
I samma tidskrift
The Journal of the Royal Statistical Society, Series C: Applied Statistics
Sannolikhetsteori och statistik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 16 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf