Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Visualization and analysis of gene expression in tissue sections by spatial transcriptomics
Visa övriga samt affilieringar
Antal upphovsmän: 212016 (Engelska)Ingår i: Science, ISSN 0036-8075, E-ISSN 1095-9203, Vol. 353, nr 6294, s. 78-82Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Analysis of the pattern of proteins or messenger RNAs (mRNAs) in histological tissue sections is a cornerstone in biomedical research and diagnostics. This typically involves the visualization of a few proteins or expressed genes at a time. We have devised a strategy, which we call spatial transcriptomics, that allows visualization and quantitative analysis of the transcriptome with spatial resolution in individual tissue sections. By positioning histological sections on arrayed reverse transcription primers with unique positional barcodes, we demonstrate high-quality RNA-sequencing data with maintained two-dimensional positional information from the mouse brain and human breast cancer. Spatial transcriptomics provides quantitative gene expression data and visualization of the distribution of mRNAs within tissue sections and enables novel types of bioinformatics analyses, valuable in research and diagnostics.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2016. Vol. 353, nr 6294, s. 78-82
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi Medicinsk genetik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:su:diva-132564DOI: 10.1126/science.aaf2403ISI: 000378816200040PubMedID: 27365449OAI: oai:DiVA.org:su-132564DiVA, id: diva2:953601
Tillgänglig från: 2016-08-18 Skapad: 2016-08-15 Senast uppdaterad: 2022-02-23Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Person

Orzechowski Westholm, JakubHuss, Mikael

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Orzechowski Westholm, JakubHuss, Mikael
Av organisationen
Institutionen för biokemi och biofysikScience for Life Laboratory (SciLifeLab)
I samma tidskrift
Science
Biokemi och molekylärbiologiMedicinsk genetik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 144 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf