Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Discrimination of epimeric glycans and glycopeptides using IM-MS and its potential for carbohydrate sequencing
Visa övriga samt affilieringar
2014 (Engelska)Ingår i: Nature Chemistry, ISSN 1755-4330, E-ISSN 1755-4349, Vol. 6, nr 1, s. 65-74Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Mass spectrometry is the primary analytical technique used to characterize the complex oligosaccharides that decorate cell surfaces. Monosaccharide building blocks are often simple epimers, which when combined produce diastereomeric glycoconjugates indistinguishable by mass spectrometry. Structure elucidation frequently relies on assumptions that biosynthetic pathways are highly conserved. Here, we show that biosynthetic enzymes can display unexpected promiscuity, with human glycosyltransferase pp-a-GanT2 able to utilize both uridine diphosphate N-acetylglucosamine and uridine diphosphate N-acetylgalactosamine, leading to the synthesis of epimeric glycopeptides in vitro. Ion-mobility mass spectrometry ( IM-MS) was used to separate these structures and, significantly, enabled characterization of the attached glycan based on the drift times of the monosaccharide product ions generated following collision-induced dissociation. Finally, ion-mobility mass spectrometry following fragmentation was used to determine the nature of both the reducing and non-reducing glycans of a series of epimeric disaccharides and the branched pentasaccharide Man3 glycan, demonstrating that this technique may prove useful for the sequencing of complex oligosaccharides.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2014. Vol. 6, nr 1, s. 65-74
Nationell ämneskategori
Organisk kemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:su:diva-100100DOI: 10.1038/NCHEM.1817ISI: 000328951000015OAI: oai:DiVA.org:su-100100DiVA, id: diva2:691941
Forskningsfinansiär
Knut och Alice Wallenbergs StiftelseVetenskapsrådet
Anmärkning

AuthorCount:13;

Tillgänglig från: 2014-01-29 Skapad: 2014-01-27 Senast uppdaterad: 2018-03-13Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(965 kB)51 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 965 kBChecksumma SHA-512
b5c60d5c2c31e47eedd01efec5650be234a18efedf1fa6a5cf7a77e42ce54603d5c93fb5899fbb8e6bcb8b599053c11dac27a51273e7e12a7e72d8e818783bcd
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Fontana, CarolinaWidmalm, Göran
Av organisationen
Institutionen för organisk kemi
I samma tidskrift
Nature Chemistry
Organisk kemi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 51 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 129 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf