Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Structural Elucidation of the O-Antigen Polysaccharide from Escherichia coli O181
Stockholms universitet, Naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för organisk kemi.
Stockholms universitet, Naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för organisk kemi.ORCID-id: 0000-0001-8303-4481
2015 (Engelska)Ingår i: ChemistryOpen, ISSN 2191-1363, Vol. 4, nr 1, s. 47-55Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Shiga-toxin-producing Escherichia coli (STEC) is an important pathogen associated to food-borne infection in humans; strains of E.coli O181, isolated from human cases of diarrhea, have been classified as belonging to this pathotype. Herein, the structure of the O-antigen polysaccharide (PS) from E.coli O181 has been investigated. The sugar analysis showed quinovosamine (QuiN), glucosamine (GlcN), galactosamine (GalN), and glucose (Glc) as major components. Analysis of the high-resolution mass spectrum of the oligosaccharide (OS), obtained by dephosphorylation of the O-deacetylated PS with aqueous 48% hydrofluoric acid, revealed a pentasaccharide composed of two QuiNAc, one GlcNAc, one GalNAc, and one Glc residue. The H-1 and (CNMR)-C-13 chemical shift assignments of the OS were carried out using 1D and 2D NMR experiments, and the OS was sequenced using a combination of tandem mass spectrometry (MS/MS) data and NMR (CNMR)-C-13 glycosylation shifts. The structure of the native PS was determined using NMR spectroscopy, and it consists of branched pentasaccharide repeating units joined by phosphodiester linkages: -> 4)[alpha-L-QuipNAc-(1 -> 3)]-alpha-D-GalpNAc6Ac-(1 -> 6)-alpha-D-Glcp-(1 -> P-4)-alpha-L-QuipNAc-(1 -> 3)-beta-D-GlcpNAc-(1 ->; the O-acetyl groups represent 0.4 equivalents per repeating unit. Both the OS and PSs exhibit rare conformational behavior since two of the five anomeric proton resonances could only be observed at an elevated temperature.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2015. Vol. 4, nr 1, s. 47-55
Nyckelord [en]
Escherichia coli, NMR spectroscopy, O-antigen, polysaccharides, structure elucidation
Nationell ämneskategori
Kemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:su:diva-116021DOI: 10.1002/open.201402068ISI: 000349953300007OAI: oai:DiVA.org:su-116021DiVA, id: diva2:801781
Forskningsfinansiär
VetenskapsrådetKnut och Alice Wallenbergs StiftelseEU, FP7, Sjunde ramprogrammet
Anmärkning

AuthorCount:3;

Tillgänglig från: 2015-04-10 Skapad: 2015-04-09 Senast uppdaterad: 2018-03-14Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(757 kB)34 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 757 kBChecksumma SHA-512
ccb7539b976b948f9b12af6db0d50efcabd315da76e6b14ae2451766a028ab4027ccc110e0b940e0efb8ba754fcbc55e352c06c1dbffe7f493922dd88e8ced28
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Fontana, CarolinaWidmalm, Göran
Av organisationen
Institutionen för organisk kemi
I samma tidskrift
ChemistryOpen
Kemi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 34 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 79 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf